อาจถูกกำหนดให้เป็นส่วนประกอบซอฟต์แวร์ที่ระบบจัดการฐานข้อมูล (DBMS) ใช้เพื่อจัดการการทำงานของ SQL ต่างๆ เช่น สร้าง อ่าน อัปเดต และลบข้อมูลออกจากฐานข้อมูล กล่าวอีกนัยหนึ่ง DBMS ใช้เพื่อจัดการข้อมูลในฐานข้อมูล เครื่องมือจัดเก็บข้อมูลที่ใช้กันอย่างแพร่หลายคือ InnoDB ซึ่งเป็นเอ็นจิ้นการจัดเก็บข้อมูลเริ่มต้นสำหรับ MySQL5.5 และเวอร์ชันที่สูงกว่า ก่อนหน้า MySQL5.5 เอ็นจิ้นการจัดเก็บข้อมูลเริ่มต้นคือ MyISAM
ด้วยความช่วยเหลือของคำสั่ง SHOW ENGINES เราสามารถตรวจสอบรายการเครื่องมือจัดเก็บข้อมูลที่รองรับโดยการติดตั้ง MySQL -
mysql> SHOW ENGINES\G
*************************** 1. row *************************** Engine: FEDERATED Support: NO Comment: Federated MySQL storage engine Transactions: NULL XA: NULL Savepoints: NULL *************************** 2. row *************************** Engine: MRG_MYISAM Support: YES Comment: Collection of identical MyISAM tables Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO *************************** 3. row *************************** Engine: MyISAM Support: YES Comment: MyISAM storage engine Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO *************************** 4. row *************************** Engine: BLACKHOLE Support: YES Comment: /dev/null storage engine (anything you write to it disappear Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO *************************** 5. row *************************** Engine: CSV Support: YES Comment: CSV storage engine Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO *************************** 6. row *************************** Engine: MEMORY Support: YES Comment: Hash based, stored in memory, useful for temporary tables Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO *************************** 7. row *************************** Engine: ARCHIVE Support: YES Comment: Archive storage engine Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO *************************** 8. row *************************** Engine: InnoDB Support: DEFAULT Comment: Supports transactions, row-level locking, and foreign keys Transactions: YES XA: YES Savepoints: YES *************************** 9. row *************************** Engine: PERFORMANCE_SCHEMA Support: YES Comment: Performance Schema Transactions: NO XA: NO Savepoints: NO 9 rows in set (0.00 sec)