แม้ว่าคุณจะสามารถคว้าแอปดีๆ มากมายจาก App Store ได้ แต่ในที่สุดผู้ใช้ Mac ทุกคนก็พบซอฟต์แวร์บางตัวที่ไม่พร้อมใช้งานที่นั่น และเมื่อถึงตอนนั้น คุณไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากต้องติดตั้งแอปดังกล่าวด้วยตนเอง ซึ่งอาจเป็นปัญหาได้เนื่องจากระบบปฏิบัติการไม่อนุญาตให้คุณเรียกใช้แอปที่มาจากนักพัฒนาที่ไม่ระบุชื่อ